АО "Канонерский судоремонтный завод" имеет Свидетельства о признании Российского морского регистра судоходства, Российского Классификационного Общества, а также иных классификационных обществ, подтверждающие соответствие выполняемых работ требованиям Правил классификационных обществ. Завод также имеет действующую лицензию Ростехнадзора, подтверждающую возможность ремонта судов с ядерным реактором.